一般不要把怕热的兽药放在仓库的朝阳面。易风化的兽药不要堆放于门窗或通道附近，以免过度风吹导致药品的有效成分散失。见光易变质的药品应避光保存。受热易挥发、分解和易变质的药品，需在特定的温度下保存。易燃、易爆，有腐蚀性和有毒害的药品都应单独放于低温处储存。疫苗等生物制品，在较高温度中易失效，宜储藏在冷藏室或冷藏柜中。化学性质作用相反的药品应分开存放，如酸类与碱类。名称容易混淆的药品应分开存放。有有效期的药品应分期分批存放。药品的品名一样，但规格不一的兽药也应分开存放，以免发放时出差错。
药品的发放应遵循"先进先出"的原则，接近失效期的药品先发，易霉易坏药品先发。
此外储存兽药的仓库，要通风良好，防火防潮，并要防止虫鼠危害、霉变和化学药品的污染。应定期打扫仓库，保持仓库内的清洁卫生。
