大量研究表明，水禽（鸭、鹅）在高致病性禽流感（HPAIV，简称禽流感）禽流感的发生、传播、流行、变异和跨种传播中起着重要的作用。水禽（鸭、鹅）是禽流感病毒重要的传播媒介，是禽流感病毒的储存器、放大器和混合器。它们既可以携带多种亚型的低致病性禽流感病毒，又能长期储存陆禽（鸡等）来源的高致病性禽流感病毒，促使禽流感病毒重组。尤其是野生水禽，更是高致病性禽流感远距离传播的重要媒介。在开放式养殖条件下，家养水禽常与野生水禽密切接触，容易发生交叉感染，通过直接或间接接触野生水禽和鸡，将禽流感病毒的传播放大，可促使高致病性禽流感病毒远距离传播，引起千里之外的家禽发病。如2016年发生在欧洲的高致病性禽流感（H5N8）经证实是野生水禽传染给家禽的。
家养水禽在某些禽流感病毒流行早期多呈隐性感染或带毒，临床无症状，但可通过粪便排毒，污染环境。易感的鸡群感染这些病毒后，可引起发病，表现高死亡率。该病毒适应鸡群后毒力返强，当重新感染水禽后，可导致水禽发病，出现高死亡率，应引起高度警惕。
目前，已进入禽流感高发季节。荆州市是水网湖区，也是家禽养殖大市，且鸡、鸭、鹅混养的现象比较普遍，由于生物安全做的较差，很容易发生禽流感病毒的交叉感染。同时，根据荆州市水禽养殖的现状（开放式养殖，基础设施差，管理粗放），必须强化秋冬季节水禽高致病性禽流感防控。一是划分养殖区域。在同一区域鸡、鸭、鹅混养，容易导致交叉感染，不利于禽流感的防控。各地应划分专门的水禽养殖区域；二是采用密闭式养殖。避免家养水禽与野生禽或鸟类的接触，避免不同禽类的交叉感染和对环境的污染；三是规范活禽运输和交易市场。规范活禽运输车辆，尽量避免活禽开放式运输。研究开发能减少病毒扩散、传播的活禽专用运输车辆。规范活禽市场，建立科学休市、空市制度，设立独立的水禽交易取区域，减少不同品种禽类的交叉污染，防止病毒变异；四是建立疫情监测预警制度。设立市县乡村四级动物疫情监测网络，开展市县两级水禽禽流感实验室监测，及时发布风险预警，“早、快、严、小”，控制禽流感的发生与传播；五是提高免疫密度，制定科学免疫程序。由于荆州市水禽的养殖模式是小规模、大群体和散养，因此水禽禽流感疫苗的免疫密度远远低于鸡，有些养殖户怕麻烦、怕影响产蛋不免疫疫苗。要加大禽流感免疫方面的宣传和检查，采取地毯式免疫，免疫密度必须达到100%。同时，禽流感疫苗免疫1～2次很难达到理想的保护率，大多数养殖场为避免注射疫苗引起产蛋下降，水禽开产后不再注射疫苗，导致抗体水平下降，离散度增高，保护率下降。因此要制定科学免疫程序，加强产蛋期疫苗的补免。即使在发病率较低的季节和区域也要坚持免疫，发挥其净化环境的重要作用。
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