支原体具有免疫逃避的能力，鸡感染后终身带菌。因为滑液囊支原体不能通过自身完成复制和繁殖，它必须进入机体的细胞内、借助机体细胞的部分片段和功能，才能完成自身的复制装配和繁殖。从这个方面讲，为什么滑液囊支原体如此难以根除了，因为它是与机体的体细胞共存亡的一旦感染鸡群，会终身带菌，机体无法通过自身的免疫反应而清除野毒。
支原体寄生位置刁钻，药效不易到达。支原体到达的气囊、关节、生殖系统都是药物难以到达的部位。
滑液囊支原体的治疗效果之所以容易反复，主要原因是平时的防控方向仅仅考虑了对病原的杀灭作用，没有考虑到以下几方面对反复感染的影响：
01
首先要清楚滑液囊支原体感染的病鸡无论如何用药，都是无法彻底根治的特点。此病原入侵细胞内，具有能够避过机体免疫系统，药物对其无法杀灭的特点。我们把药物作为常用治疗手段时，最多能够达到效果是“病原与机体的免疫系统达到某种平衡，实现了共存而已”。这样的鸡群一旦遇到强应激、免疫抑制性因素(免疫抑制性病毒感染、霉菌毒素)和营养缺乏等问题时，仍旧会有复发。
02
一定要重视引种选择，滑液囊支原体的感染不仅仅是垂直传播，疫苗MS污染、注射疫苗针头的不消毒也是导致鸡群感染MS的重要途径;环境中MS病原通过呼吸系统也可以感染鸡群。
03
如果鸡群有腺肌胃炎，就容易发病。由于胃肠消化吸收功能低，胃肠道粘膜上皮细胞的更新所需要的营养难以满足，就会引起肠粘膜屏障功能难以维系，黏膜免疫屏障功能也比较差，滑液囊支原体就会突破胃肠道的化学和免疫屏障，导致鸡群发病，诱发各部位滑液囊的感染。
04
鸡群参与骨骼和皮肤生长的维生素缺乏。骨骼的骺端软骨发育不良，也是关节附近容易继发感染病原的重要因素;这个缺陷导致滑液囊支原体的反复感染。
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治疗过程中，只治疗病不调理鸡，药物剂量不足，疗程不够，不解除免疫抑制，导致反反复复不易彻底。从免疫学来分析，滑液囊支原体可以影响鸡骨髓造血功能，鸡群不论什么日龄段接种的任何疫苗都影响有效的抗体的产生。这也是为什么得了滑膜炎的鸡大多会继发新城疫的原因。
所以防控滑液囊支原体不是你死我活的零和博弈，而是要适度压制它的破坏力求共存共生，应该采取的措施是减应激，补营养，尤其是骨骼中的软骨组织，这个地方是滑液囊支原体进入体内的地方，这个地方健康了，滑液囊支原体就失去了生存之地，就类似于防控球虫要管理好湿度一样的道理。不单纯治病，而要从治鸡，提高其免疫力和自身抗病能力作为首要任务。
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