兽医临床上，凡是对病原菌具有选择性的抑制或杀灭作用，同时对动物机体没有或只有轻度毒性作用的物质，我们把它们统称为抗菌药物。
那么使用这些药物来治疗由病原菌所致的疾病称为抗菌治疗。抗菌药物在用于畜禽防治疾病的过程中，药物、机体、病原菌之间存在相互作用的关系。
1.抗菌药物抗菌谱
抗菌谱是指药物杀灭或抑制病原微生物的范围。由于药物作用范围的差异，又分为广谱与窄谱。作用广泛，能杀灭或抑制多种不同种类的细菌的抗生素，称为广谱抗生素，如四环素;仅作用于一定种类细菌的抗生素，称为窄谱抗生素，如青霉素、链霉素。
2.抗菌药之抗生素
抗生素是真菌、细菌、放线菌等微生物产生的代谢物质，有抑制或杀灭病原体的作用。抗生素除能从微生物培养液中提取外，已有不少品种能人工合成或半合成。这不仅增加了抗生素的来源和种类，还扩大了临床应用范围。有些抗生素还具有抗病毒、抗肿瘤和抗寄生虫的作用。
3.抗菌药抗菌机制
抗菌药的抗菌作用机制，对于研究抗菌的有效使用，提高抗菌药的临床治疗效果，至关重要。绝大部分抗菌药的作用，主要是干扰病原微生物的代谢过程而发挥其抗菌作用都，总体来看抗菌药的抗菌作用机制大致可分为以下四种类型。
4.抑制细菌核酸的合成
核酸包括脱氧核糖核酸( DNA )和核糖核酸( RNA )。核酸具有调控蛋白质合成的功能。许多抗菌药具有抑制细菌合成核酸的能力，从而引起细菌的死亡而呈现抗菌作用。如灰黄霉素可阻碍 DNA 的合成，利福平可阻碍 RNA 的合成。
5.增加细胞膜的通透性
细菌的细胞膜是紧贴细胞壁内、围绕在细胞浆外，由类脂和蛋白质分子构成的半透膜。它具有维持渗透屏障和运输营养物质的功能。当胞浆膜受损后，通透性增加，细胞的重要营养物质如核酸、氨基酸、酶等大量外漏而导致细胞破裂死亡。抗菌药中的多肽类和多烯类具有损伤细菌胞浆膜、增加细胞膜通透性的作用。
6.抑制细菌蛋白质的合成
蛋白质的合成共分三个阶段，即起始阶段、延长阶段和终止阶段。只要抑制其中任何一个阶段就能阻碍蛋白质的合成，使细菌不能生长繁殖。不同的抗菌药对三个阶段的作用不完全相同，如氨基糖苷类对三个阶段都有作用，而林可胺类只作用于延长阶段。
细菌与哺乳动物细胞合成蛋白质的过程相同，最大的区别在于核糖体的结构不同。细菌核糖体的沉降系数为70s,并可解离为50S与30S亚基;而哺乳动物的细胞核糖体沉降系数为80s，并可解离为60S与40S亚基。这种差别使抗菌药可以选择性地作用于细菌，表现抑菌或杀菌作用，而对动物机体毒性小。
7.抑制细菌细胞壁的合成
细菌的结构与动物细胞不同，在细胞膜外还有一层具有保护细菌免受机械损伤和外界渗透压影响的坚韧组织﹣细胞壁。革兰阳性菌细胞壁的主要成分是黏肽，黏肽是一种肽多糖聚合体。
青霉素类、头孢菌素类等抗生素，其结构中含有和黏肽中局部结构相似的 β﹣内酰胺环，它能结合到黏肽的肽链上，从而阻止黏肽的交叉连接，造成细胞壁缺损，使细胞外的水分渗人菌体内，导致菌体膨胀变形、破裂死亡。
因此，青霉素类对生长旺盛的细菌作用强，而对静止状态下的细菌作用弱，因为前者需要不断地合成细胞壁，而后者已经合成细胞壁，不受青霉素影响，故这类抗生素称为繁殖期杀菌剂。革兰阴性菌因细胞壁的主要成分是磷脂，故青霉素类对其作用弱。
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