畜禽疾病有传染性和非传染性之分，危害最大的是传染性疾病。
传染病的发生有三个要素：传染源、传播途径、易感动物。另外一种提法是“发病学的三因素”，养殖环境中病原微生物的量是多或是少、易感动物（动物的体况？有没有受到应激？抗体，包括残留抗体和母源抗体的高或低等？）的多或是少、病原微生物的毒力是强还是弱决定了疫病会不会发生。
健康养殖和生物安全是个系统的工程，简单的说无抗养殖就是健康养殖、就是食品安全，这是片面的。食品安全是规范生产的结果，不是检测出来的。
现在比较新的提法是畜禽生产以养为主、养重于防、防重于治，养防结合的综合防治。畜禽是一个经济动物，不同于人和宠物，人可以花很多的钱来治病，但是经济动物讲的是效益，所以要以预防为主。
好的兽医不是治好病，而是让畜禽不发病！
基层养殖人员经常会问，治疗某种疾病用什么药？却不探究疾病是由于环境因素、应激因素、营养或者有毒物质摄入等能导致了动物机体的正常功能受损而发生的，这也成就了畜禽健康养殖的七大法宝，消毒隔离、加强管理、疫苗接种、合理用药、环境熟悉、种源净化、饲料优质。
如何利用这七大法宝来对付畜禽疾病？
法宝一：消毒隔离
消毒就是让饲养环境中病原微生物的量减少，越少越好，没有最好。
消毒、隔离是构建蓄禽场生产安全体系的重大的措施。识别威胁畜禽生产的风险因素，通过科学有效的技术手段和管理措施加以控制，防止和切断病原体的侵入，这就是生物安全，包括外部的生物安全和内部的生物安全。
外部的生物安全主要是防止病原微生物通过载体传到场内，或者是防止鸡场、猪场里面的病原往外面传播。载体是什么？人流、物流、啮齿动物、昆虫、水源、饲料等等。
内部生物安全主要是控制场内病原微生物在畜禽间的循环传播。
做好内部生物安全的基本原则是：第一、净污分区。这条是洁道、这条是脏道，如果拉饲料的地方会拉粪便，就会交叉感染；第二、单向流动。不能逆向流动；第三、分区管理。一般分成饲养区、生活区，还有育雏、育成区，还有环保、孵化有关的设施一定要严格分区管理；第四、封场管理。在遇到重大疾病威胁、疾病高发季节的时候，要有严格的封场管理措施;第五、有效消毒。
怎么消毒才有效？我们强调有效的消毒，效果行不行要进行监控。
鸡场、种鸡场防御要分区，按照生物安全的等级，由高到底依次分红、黄、绿三个等级，红区指场外区域、黄区是指生活区和环保区、绿色的区就是生产区，一定要严格的分区管理。
建设的消洗中心，要有三个区，有红区、有黄区、绿区，经过非常严格的消毒和隔离程序才进入了绿色区域，还要对关键环节进行检查。
消毒和隔离是密切联系的，消毒的非常干净，紧接着再污染就降低了消毒的意义，所以这是个长期的、严格的工作。
法宝二：加强管理
管理是一门科学，人管人管死人，管理要有各种制度、有规矩。消毒有制度、进出仓要有制度，一定要规范、要标准;办事要有流程，不是拍脑袋，要有据可依。
用制度管人、按流程办事，规范化、制度化和标准化的管理能够提升效益，所以包括饲料厂、种鸡场、种猪场一定要强化管理。
具体到生产上，养禽场很重要是水质的管理和垫料的管理。
100米以内的水是地表水，由大量的微生物（大肠杆菌及、沙门氏杆菌等）；另外要注意水质有没有重金属（鸡群饮用后拉稀，拼命吃药，检查发现硝酸盐超标），所以水质管理很重要。
长期不清理水线，会有很多水垢，外加维生素和药物（无水乳糖、葡萄糖）的残留，很容易堵塞水管，还会形成生物膜。
大肠杆菌也是个最典型的机会主义的细菌，无处不在，无时不有，很容易在水和垫料里面存在。垫料里还会有很多有害气体，特别是氨气大量的集聚，是肉鸡后期死亡很重要的课题，所以管理非常重要。
地面养鸡会有球虫，有很多大肠杆菌，后期吃的多拉的多，行业共有的经验是网上养的鸡比地面养的好。
笼养在通风、环控、料线、水线、化粪线都是现代化的管理，包括粪便也是一天刮一两次，排泄物、粪便强调环保，粪便和病死畜禽无害化管理，这是管理很重要的内容。
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